งานควบคุมคุณภาพ ทำหน้าที่ควบคุม ติดตาม และตรวจสอบคุณภาพของวัตถุดิบและ ผลิตภัณฑ์ของโครงการฯ ตลอดกระบวนการผลิต ก่อนดำเนินการจัดจำหน่าย ตามมาตรฐาน ของคณะกรรมการอาหารและยา (อย.) โดยทำการตรวจสอบด้วยวิธีการทางกายภาพ เคมี และชีวภาพ
งานประกันคุณภาพ ทำหน้าที่ตรวจสอบคุณภาพของวัตถุดิบ บรรจุภัณฑ์ สารเคมี รวมทั้ง น้ำที่ใช้ในกระบวนการผลิต เพื่อเป็นการประกันคุณภาพของวัตถุดิบ บรรจุภัณฑ์ สารเคมี และ น้ำที่ใช้ในการผลิตว่ามีคุณภาพอยู่ในเกณฑ์มาตรฐาน ก่อนนำไปใช้ในกระบวนการผลิตต่อไป
งานควบคุมผลิตภัณฑ์ มีหน้าที่รับผิดชอบในการจัดทำและควบคุมเอกสารในระบบ GMP (Good Manufacturing Practice) ซึ่งหมายถึง หลักเกณฑ์ และวิธีการที่ดีในการผลิต สำหรับ โรงงานผลิตอาหารให้มีความปลอดภัยต่อผู้บริโภค